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生物信息學(xué)分析--NGS數(shù)據(jù)分析

 

       隨著Next-Gen sequencing(NGS)技術(shù)的不斷發(fā)展，測(cè)序的速度不斷加快，對(duì)測(cè)序產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析變得越來(lái)越重要。面對(duì)巨大的數(shù)據(jù)樣本，如何快速高效的找出對(duì)研究有關(guān)鍵指導(dǎo)意義的數(shù)據(jù)是研究者們面臨的新的挑戰(zhàn)。我們組建專(zhuān)業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì)，對(duì)NGS測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行深入的數(shù)據(jù)挖掘，旨在為研究者提供專(zhuān)業(yè)便捷的數(shù)據(jù)分析途徑。

 

服務(wù)內(nèi)容：
 

       轉(zhuǎn)錄組分析（有參）：轉(zhuǎn)錄組是特定物種、組織或細(xì)胞類(lèi)型轉(zhuǎn)錄的所有RNA（轉(zhuǎn)錄本）的集合，包括mRNA和非編碼RNA(Non-coding RNA， 非編碼RNA又包括：tRNA，rRNA，snoRNA，microRNA，piRNA，lncRNA等。通過(guò)比較轉(zhuǎn)錄組或基因表達(dá)譜的研究以揭示生物學(xué)現(xiàn)象或疾病發(fā)生的分子機(jī)制是高通量組學(xué)研究的一個(gè)常用策略。利用高通量測(cè)序技術(shù)研究轉(zhuǎn)錄組在全面快速得到基因表達(dá)譜變化的同時(shí)，還可以通過(guò)測(cè)定的序列信息精確地分析轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)差異情況以及表達(dá)差異所對(duì)應(yīng)的生物學(xué)特征和途徑。

 

轉(zhuǎn)錄組分析（有參）過(guò)程簡(jiǎn)介：
 

 
 
結(jié)果展示：

轉(zhuǎn)錄組分析（有參）數(shù)據(jù)分析樣本



熱圖：樣品間相關(guān)系數(shù)熱圖；散點(diǎn)圖：樣品間的相關(guān)系數(shù)散點(diǎn)圖




有顯著性差異表達(dá)的基因用紅色點(diǎn)（上調(diào)）和綠色點(diǎn)（下調(diào)）表示，無(wú)顯著性差異表達(dá)的基因用藍(lán)色點(diǎn)表示；橫坐標(biāo)代表基因在不同樣本中表達(dá)倍數(shù)變化；縱坐標(biāo)代表基因表達(dá)量變化差異的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性




整體RPKM層次聚類(lèi)圖，以log10(RPKM+1)值進(jìn)行聚類(lèi)，紅色表示高表達(dá)基因，綠色表示低表達(dá)基因




縱坐標(biāo)為富集的GO term，橫坐標(biāo)為該term中差異基因個(gè)數(shù)。不同顏色用來(lái)區(qū)分生物過(guò)程、細(xì)胞組分和分子功能，帶“*”為顯著富集的GOterm




Cellular Component DAG plot of GO result




縱軸表示pathway名稱(chēng)，橫軸表示Rich factor，點(diǎn)的大小表示此pathway中差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)多少，而點(diǎn)的顏色對(duì)應(yīng)于不同的Qvalue范圍




顯著富集的KEGG pathway代謝通路圖,其中紅色部分為差異基因




蛋白互作網(wǎng)絡(luò)

 

服務(wù)特色：
 

      轉(zhuǎn)錄組是細(xì)胞功能探究的重要環(huán)節(jié)，通過(guò)探究不同樣本間轉(zhuǎn)錄本的差異，可以分析出樣本間功能差異的原因。因此，本公司建立專(zhuān)業(yè)的NGS數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì)，提供個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析，旨在為您提供更好的服務(wù)，為您的科研事業(yè)增添助力。
 

NGS數(shù)據(jù)分析,NGS數(shù)據(jù)分析

NGS數(shù)據(jù)分析信息由廣州輝園苑醫(yī)藥科技有限公司為您提供，如您想了解更多關(guān)于NGS數(shù)據(jù)分析報(bào)價(jià)、型號(hào)、參數(shù)等信息，歡迎來(lái)電或留言咨詢(xún)。

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